La Consola Virtual es una parte de la tienda que, en semejanza al servicio de Wii, recopila juegos de Game Boy y Game Boy Color. Este servicio se estrenará con dos de los juegos más populares de cada una de las dos plataformas. Game Boy recibirá Super Mario Land, el primer título de la saga de Mario para las consolas portátiles. Por su parte, Game Boy Color recibirá The Legend of Zelda: Link’s Awakening DX (un remake a color que incluía una nueva mazmorra).
Nintendo aún no ha dado ninguna información sobre el precio de los juegos de este servicio.