Después toca ponerse manos a la obra. Nos iremos encontrando diferentes enemigos, algunos muy sencillitos mientras que otros nos podrán las cosas más complicadas, por lo que ir siempre a lo loco no es buena idea. Comprobar la mejor manera de abordar a cada uno y una vez logrado dejarñan caer diferentes objetos que nos servirán para posteriormente en unos portales mejorar nuestras habilidades como el daño de ataque, resistencia de defensa, la salud entre otras cosas. Un detalle curioso es que si morimos, nosotros comenzaremos desde el último punto de control. Pero al llegar a la zona de nuestro cadáver, no desaparece, se convierte en un enemigo más.
Los modos principales serán arcade e historia, ambos tienen la posibilidad de jugarse de manera cooperativa a pantalla partida que siempre es una buena opción, aunque la online también se agradece mucho. Por otra parte Aniquilation también ofrece un modo competitivo en plan batallas. Mientras juguemos algunos de los enemigos derrotados dejarán caer ítems de ayuda que nos serán muy útiles, pero antes de llegar a cada uno de los planetas, habrá una pequeña fase en la que iremos sobre railes e iremos recogiendo orbes a modo de impulso final para alcanzar nuestro destino.